Lancet Oncol:肾透明蛋白质癌与肥胖悖论相关的转录组特征分析

2021-11-02 10:15:21 来源:
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一.研究课题背景

肥胖关节炎与膀胱半透明巨噬细胞腺癌 (ccRCC)的风险减低有关,但肥胖关节炎又分歧地与该的预后改善有关,其潜在机制尚不确切。附属所写对肥胖关节炎病征和正常人BMI病征在原发和疣周脂质组织前的静脉分解成和免疫磷酸化组歧异进行研究课题研究课题。

本文概述了遗传物质所列达引起的微环境的歧异有助于阐释肥胖关节炎病征的肉食动物优势(肥胖关节炎猜想)。

二.研究课题流程三.篇文章讲解1.COMPARZ所列头、TCGA-KIRC所列头、MSK免疫病人所列头数据资料搜集、矫正

在COMPARZ所列头的453名病征前,有375名(83%)病征具备可用的单链数据资料,病人前BMI测量以及无进展和上都肉食动物数据资料进行研究课题(所列1)。除119名(26%)增重病征外,来自COMPARZ试验的再度所列头包含256名(68%)病征(n=256)。

所列1.COMPARZ临床研究所列头的人口比同上统计学和临床特征

TCGA-KIRC所列头前的332同上病征前,检验了经膀胱切除练成病人的152同上(46%)晚期(即AJCC III和IV期)ccRCC病征的临床和人口比同上统计学数据资料(所列2)。在排除59名(39%)增重病征后,最后获取的所列头包含93名病征(n=93)。

所列2.晚期半透明巨噬细胞膀胱巨噬细胞腺癌TCGA-KIRC所列头的密切相关和临床特征

从62同上MSK四周脂质组织所列头前进行膀胱脏切除练成的非转移性半透明巨噬细胞RCC病征前获取了原发性和四周脂质材料。在这个所列头前,从59名病征的PNN(膀胱周附近)四周脂质,25名病征的PNA(远离膀胱周)四周脂质以及55名病征的组织前取样。在排除增重病征之后,再度所列头包含41名(69%)PNN采样病征, PNA采样为17(68%),采样为37(67%)。从最初的203名组织者的MSK免疫病人研究课题群集体前排除74名(36%)增重病征后,总肉食动物研究课题的再度所列头包含129名(64%)组织者(所列3)(n=129)。

所列3. 采用MSK免疫病人的临床研究所列头的人口比同上统计学和临床特征

2.肥胖关节炎的膀胱半透明巨噬细胞腺癌病征值得注意正常人BMI的膀胱半透明巨噬细胞腺癌病征总肉食动物期更长

根据KM肉食动物研究课题,在三组前都发附属肥胖关节炎病征的总肉食动物期更长。在TCGA-KIRC所列头前,经分期测量仪器后,肥胖关节炎病征的上都存活期尤精正常人BMI组;在COMPARZ所列头前,经IMDC风险总分测量仪器后,胖病征的上都存活期也尤精正常人BMI组。在MSK免疫疗法所列头前,经IMDC风险总分测量仪器后,BMI与死亡率的无众所周知歧异(如示意图1)。

示意图1.TCGA-KIRC所列头 (A)、COMPARZ 所列头(B)和MSK免疫病人所列头(C)的总肉食动物期

3.COMPARZ所列头前肥胖关节炎病征具备更快的PFS

对CPMPARZ所列头KM研究课题后,KM圆弧所列明,COMPARZ所列头前肥胖关节炎病征比正常人BMI病征具备更快的PFS。

示意图S1.COMPARZ所列头前肥胖关节炎病征比正常人BMI病征具备更快的PFS

4.适用队内药物病人,肥胖关节炎病征仍具备更快的OS

KM圆弧所列明了在适用队内嘧啶激酶抑制剂(pazopanib或Sunitinib)的两个病人组前,肥胖关节炎病征的OS即使如此较正常人BMI病征好。

示意图S2.COMPARZ所列头适用队内药物病人组的总肉食动物期研究课题

5.COMPARZ所列头前,肥胖关节炎与正常人BMI的病征磷酸化组遗传物质特征存在众所周知歧异

再多上述研究课题,所写在三个所列头前获知肥胖关节炎猜想存在之后,接下来在COMPARZ所列头前对肥胖关节炎和正常人BMI病征检验了磷酸化组学歧异。先是做了Hallmark遗传物质集的GSEA研究课题,比较肥胖关节炎病征与正常人BMI病征错综复杂的歧异:肥胖关节炎病征前所列明肺部、TGF-β、黏膜-时有充质转变和静脉分解成信号渠道众所周知调高,提示内脏愈合途径的激活(示意图A)。示意图B是对示意图A挑选的几个遗传物质所列达渠道的Enrichment plots。

示意图S4.COMPARZ所列头前肥胖关节炎病征与正常人BMI病征的ccRCC磷酸化组遗传物质特征存在众所周知歧异

6.COMPARZ所列头与TCGA-KIRC所列头 前肥胖关节炎比正常人BMI病征的静脉分解成总分高

在GESA为基础的特征遗传物质集静脉分解成总分比较前,肥胖关节炎病征极低正常人BMI病征(如示意图2)。

示意图2.COMPARZ所列头(A)与TCGA-KIRC所列头 (B)前肥胖关节炎原发病征与正常人BMI病征的静脉分解成的z score

7.正常人BMI与肥胖关节炎病征的免疫巨噬细胞群集无众所周知歧异

对正常人BMI(7同上)与肥胖关节炎(16同上)病征的原发的主要免疫巨噬细胞数量均采用流式巨噬细胞练成进行检验。示意图A所列明了肥胖关节炎病征与正常人病征错综复杂的免疫巨噬细胞群集的上都歧异。示意图B确切所列明了肥胖关节炎和正常人BMI病征T巨噬细胞群集的浸润水平。发附属正常人BMI与肥胖关节炎病征的免疫巨噬细胞群集无引人注意歧异,免疫巨噬细胞浸润的程度与BMI毫无关系。

示意图S9.用流式巨噬细胞练成研究课题正常人BMI与肥胖关节炎病征的免疫巨噬细胞群集无引人注意歧异

8.与正常人BMI病征相比,肥胖关节炎病征疣周脂质组织炎关节炎减低,尤其是附近的疣周脂质

在MSK的非转移性ccRCC病征的前瞻性所列头前,所写合并了20个最众所周知的丰富的IPA规范渠道,这些渠道来自于肥胖关节炎和正常人BMI病征的PNN和PNA采样的比较(示意图A)。肥胖关节炎和正常人BMI病征的PNN和PNA采样错综复杂的免疫浸润(ssGSEA总分)比较(示意图B)。

示意图S5.与正常人BMI的病征相比,肥胖关节炎病征的膀胱周脂质所列引人注意附属出炎关节炎和肺部减低

综上,在COMPARZ试验所列头前,经过IMDC风险总分调整后,发附属值得注意正常人BMI病征,嘧啶激酶抑制剂病人提高了肥胖关节炎病征的肉食动物率,相当多是遵从sunitinib病人的病征。IMDC风险总分建模包含的组分时有接凸显宿主因素对腺癌关节炎更进一步炎关节炎作用(同上如高血压,前性粒巨噬细胞升高,和血小板升高关节炎),这些因素可能也是免疫病人结果和BMI错综复杂关联机制的原因。发附属肥胖关节炎病征的静脉分解成分数极低正常人BMI病征,与前其他的研究课题结果所列明的,参与静脉分解成,β-氧化途径等等遗传物质的富集的附属象一致。因此,静脉分解成的歧异可以部分阐释肥胖关节炎病征遵从嘧啶激酶抑制剂病人后的较好预后。

此研究课题为肥胖关节炎猜想提供了生物学支持。在患有ccRCC的病征掩蔽到肥胖关节炎病征值得注意正常人BMI的病征微环境的歧异:相当多是肥胖关节炎病征的的静脉分解成减低,但上都炎关节炎无引人注意歧异。众所周知的是肥胖关节炎病征的四周脂质所列明减低的炎关节炎和肺部状况。半透明巨噬细胞腺癌与疣周脂质组织微环境的复杂相互作用可能具备临床意义,值得进一步研究课题。

原始显附属出处:

Sanchez A, Furberg H, Kuo F, Vuong L, Ged Y, Patil S, Ostrovnaya I, Petruzella S, Reising A, Patel P, Mano R, Coleman J, Russo P, Liu CH, Dannenberg AJ, Chan TA, Motzer R, Voss MH, Hakimi AA. Transcriptomic signatures related to the obesity paradox in patients with clear cell renal cell carcinoma: a cohort study.Lancet Oncol. 2020 Feb;21(2):283-293

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